1. Wrecking Ball (Green Hill Zone)
První boss ve hře je asi ten nejlehčí. Jediné, co máte dělat je vyhýbat se blížící se kouli skokem do vzduchu a zasáhnout Robotnika 8x.
2. Fireball Shooter (Marble Zone)
Opět musíte Robotnika zasáhnout 8x a přitom dávat pozor na to, abyste nespadli do lávy. Přeskakujte z jedné plošinky na druhou, protože Robotnik bude házet takové ohýnky, které vás popálí.
3. Spike Weapon (Spring Yard Zone)
Robotnik se vás bude snažit zasáhnout zvrchu takovým bodlákem, co trčí z jeho vozítka, uhněte mu a zasáhněte ho, musíte provést 8x. Bacha, abyste nespadli do děr, které Robotnik bude vytvářet, když vás nezasáhne, zničí vždycky 1 kostku a když spadnete, umřete.
4. Retreat (Labyrinth Zone)
Zde nemusíte Robotnika zasáhnout, protože zde budete utíkat před stoupající hladinou vody. Musíte se vyhýbat různým bodlákům a havěti, nejsou zde žádné bubliny s kyslíkem a když hladina stoupne nad vás, musíte se rychle dostat na vzduch, nebo se utopíte. Nahoře Robotnik uletí pryč ve svém voze.
5. Mine Dropper (Star Light Zone)
Robotnik je mimo Sonicův dosah, proto musíte k jeho poražení použít takové 3 převažovací lavky, Robotnik bude spouštět na ty lavky bomby a když skočíte na druhý konec lavky, mina poletí nahoru a může zasáhnout Robotnika. 8x musíte Robotnika zasáhnout a to tak, že buď minama, nebo sebou, když Robotnik hodí bombu na druhý konec lavky, na které stojíte.
6. Final Zone(South Zone)
Nejsou zde žádné kroužky a v místnosti jsou 4 takové sloupy, pokaždé půjdou dolů 2 aby rozmačkaly Sonica. V jednom je vždycky Robotnik a tak ho můžete bouchnout, musíte to zopakovat 8x. Po tomto bossovi je konec hry.